Missing coverage evidence...
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TTGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGA  >  minE/126994‑127034 |                                         ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCTGa  <  1:743030/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:599762/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:286095/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:289288/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:30974/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:399709/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:401228/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:436752/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:440738/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:535964/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:546020/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:554863/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:55649/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:253681/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:626939/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:684679/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:691665/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:712532/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:73493/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:801988/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:824371/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:943861/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:98864/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1303310/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1032621/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1034288/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1041777/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1056073/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1069457/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:110378/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1120792/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1173462/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1215254/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:122746/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1021072/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1308351/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1311310/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1337596/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:13634/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1368194/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1429026/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:1539552/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:182385/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:182470/41‑1 (MQ=255) ttGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGa  <  1:227597/41‑1 (MQ=255) |                                         TTGCGGCATTTCGCCGAGCAATGAGCTATGTTTGAACCAGA  >  minE/126994‑127034

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑