Missing coverage evidence...
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CTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAA  >  minE/2017143‑2017205 |                                                               cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCtaa  <  1:1486236/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:608413/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:328962/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:339780/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:401364/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:411755/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:441329/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:460976/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:512023/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:513983/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:545854/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:27634/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:717867/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:735930/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:759609/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:775937/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:831037/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:8375/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:884597/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:888972/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:987366/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1402077/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:100358/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1077722/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1114770/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1122899/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:115490/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1166499/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1182882/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:127500/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1003356/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1420172/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1441043/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1486477/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:151483/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:151838/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1552539/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:161767/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:270931/63‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATCCAGACGGTAATTCTTCaaa  <  1:1314966/63‑1 (MQ=255) |                                                               CTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAA  >  minE/2017143‑2017205

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑