Missing coverage evidence...
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CCCGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGCGTCGGCGATGTGATCTACCTGACCGGTACGCTGGTGA  >  minE/2058104‑2058174 |                                                                       cccGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGAGTCgg                                  >  1:267120/1‑39 (MQ=255) cccGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGAGTCGGc                                 >  1:1281272/1‑40 (MQ=255) cccGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGAGTCGGCGAtg                             >  1:661470/1‑44 (MQ=255) cccGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGAGTCGGCGATGTGATCTACCTGACCGGTACg         >  1:1510871/1‑64 (MQ=255) cccGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGAGTCGGCGATGTGATCTACCTGACCGGTACGCTGGTg   >  1:353923/1‑70 (MQ=255) cccGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGAGTCGGCGATGTGATCTACCTGACCGGTACGCTGGTg   >  1:402633/1‑70 (MQ=255) cccGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGAGTCGGCGATGTGATCTACCTGACCGGTACGCTGGTGa  >  1:613454/1‑71 (MQ=255) cccGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGAGTCGGCGATGTGATCTACCTGACCGGTACGCTGGTGa  >  1:1503440/1‑71 (MQ=255) 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CCCGATCAAAGCTGAAGATCTGCAAGATATTCGCGTCGGCGATGTGATCTACCTGACCGGTACGCTGGTGA  >  minE/2058104‑2058174

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑