Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2106508	2106555	48	143 [0]	[1] 59	agaA	predicted truncated N‑acetylgalactosamine‑6‑phosphate deacetylase

GACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAC  >  minE/2106535‑2106626                      |                                                                       gACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGCTGTTGATg                       >  1:599859/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCGTCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1106003/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGaa                                      >  1:117734/1‑35 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATgg                      >  1:1287161/1‑51 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATgg                      >  1:1499206/1‑51 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:316661/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:439588/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:434544/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:432043/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:386728/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:369563/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:537159/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:313173/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:304795/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:297931/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:272679/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:252961/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:485987/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:505561/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:984137/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:547428/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:557034/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:606866/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:619495/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:706560/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:728256/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:774644/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:78578/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:818635/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:967696/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1020615/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1257785/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1083582/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1111850/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1113277/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1113739/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1124266/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:112908/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:115968/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1221346/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1222208/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1228424/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1235112/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1239867/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:183700/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1265484/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1280702/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:132203/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1328287/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1344736/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1366029/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1392095/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1404037/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1453534/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1460261/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1465104/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1488062/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAc  >  1:1547003/1‑71 (MQ=255)                      aGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGAGCGAATTCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCTCTTAAAc  >  1:615771/1‑71 (MQ=255)                      |                                                                       GACGGGCGTAACGCCTGCGGAAGCCATCCATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAAC  >  minE/2106535‑2106626

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑