Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2112337	2112437	101	106 [0]	[0] 69	agaI/yraH	galactosamine‑6‑phosphate isomerase/predicted fimbrial‑like adhesin protein

TATAATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACA  >  minE/2112438‑2112497 |                                                            tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:525669/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:621343/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:618864/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:580124/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:568361/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:566159/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:551269/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:541703/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:526436/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:644983/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:523385/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:498513/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:334552/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:333235/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:32395/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:311538/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:290673/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:287793/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:870585/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:991099/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:95857/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:933000/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:925339/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:916594/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:915817/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:915063/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:901018/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:282348/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:828496/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:760087/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:733558/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:677663/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:666039/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:662793/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:659116/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1274996/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:138568/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1371596/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1363531/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1360026/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1335181/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1314479/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1303370/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1301701/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1413435/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1267872/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1231839/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1188574/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1170768/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1126647/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1117888/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1077203/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1541421/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:276246/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:2505/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:237095/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:236135/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:224841/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:175685/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:156095/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1546424/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1065321/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1524143/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1518824/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1518795/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:150856/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1501331/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:1446443/60‑1 (MQ=255) tataATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACa  <  1:142140/60‑1 (MQ=255) |                                                            TATAATCTTTAAAGATGTTGAACATATATTCACATTAAATATGATTATGTACTTGTTACA  >  minE/2112438‑2112497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑