Missing coverage evidence...
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GCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTTCGT  >  minE/2188217‑2188287 |                                                                       gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:71991/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1057573/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:403935/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:447222/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:527508/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:56231/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:586399/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:588133/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:639911/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:357419/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:73085/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:753529/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:83059/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:833209/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:889489/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:96890/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:975943/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1519117/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1150197/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1190025/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1254515/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1321080/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1326494/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1362470/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1392436/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:330535/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:1531510/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:219470/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:227211/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:233225/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:280780/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:299786/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:320455/71‑1 (MQ=255) gCCCATGATGTGGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTtcgt  <  1:790213/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GCCCATGATGTTGTAGGTACTGCCGATACCACCATCAGCGCCCGCCAGCAGACCAGAGGCGAAGATTTCGT  >  minE/2188217‑2188287

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑