Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2225018 2225349 332 21 [0] [0] 76 [prmA] [prmA]

AATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAA  >  minE/2225350‑2225404
|                                                      
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTTTTTTCTaa  <  1:670217/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:527810/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:682967/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:680248/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:668425/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:64761/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:608566/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:607163/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:592703/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:561375/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:715017/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:523350/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:477714/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:436506/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:388108/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:384814/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:383385/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:383189/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:321132/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:854235/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:995013/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:972156/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:955593/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:933191/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:931904/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:908732/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:875525/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:873476/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:87137/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:300081/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:819643/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:798921/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:772688/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:771843/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:766682/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:75567/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:744984/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:725303/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1138220/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1001655/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1338068/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1327894/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1284830/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:127217/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1256890/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1165220/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1140634/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1139521/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1350275/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:110773/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1103664/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1093631/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1073634/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1048041/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1045785/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1018484/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1002942/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1544597/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:294809/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:292994/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:267845/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:238440/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:229633/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:172369/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:162011/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:160197/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:15860/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1373040/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1524594/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:150337/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1433580/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1402470/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1396140/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:138851/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1378112/55‑1 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTCGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTaa  <  1:1262889/55‑1 (MQ=255)
|                                                      
AATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAA  >  minE/2225350‑2225404

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: