Missing coverage evidence...
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ACAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTG  >  minE/2381950‑2382019 |                                                                      aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCTGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGctct   >  1:407374/1‑69 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATaa                       >  1:580111/1‑49 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAAc                      >  1:1402860/1‑50 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGctc    >  1:1183666/1‑68 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:334042/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:288285/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:439818/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:463590/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:486850/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:504432/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:559783/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:648222/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:707447/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:756504/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:78294/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:785453/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:878474/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:914175/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:944179/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:958609/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:997695/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1423678/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1131394/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1177950/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1190327/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1219392/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1266919/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1282093/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:13024/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1353394/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1122462/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1457010/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1477507/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1491532/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1517044/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:1525104/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:200717/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:256446/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:259956/1‑70 (MQ=255) aCAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGAAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTg  >  1:762492/1‑70 (MQ=255) |                                                                      ACAGCAATAGAGGTAGACGGGCCGCCGATACCGGTAGAGCAGACGATAACAGGTTTACCATCCAGCTCTG  >  minE/2381950‑2382019

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑