Missing coverage evidence...
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TGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGAA  >  minE/2403250‑2403319 |                                                                      tGCTCGCGCTTACCCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:1521076/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGTGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:726281/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAAc                    >  1:793839/1‑52 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:566363/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:996667/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:952518/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:800668/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:667206/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:662950/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:648438/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:624123/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:610063/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:597593/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:572169/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:567911/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:100855/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:483793/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:483697/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:35249/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:328200/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:1513713/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:1491791/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:1407749/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:1326918/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:1285339/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:1218264/1‑70 (MQ=255) tGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGaa  >  1:1149010/1‑70 (MQ=255) |                                                                      TGCTCGCGCTTAACCACTTGCATAAAACCGATATTGGCGCGCTCCGGAAAACGCTCGTGGCTTTCCAGAA  >  minE/2403250‑2403319

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑