Missing coverage evidence...
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GAGCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGC  >  minE/2408940‑2409004 |                                                                 gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAAt                 >  1:27390/1‑50 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:60227/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:171751/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:200353/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:209116/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:234383/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:336405/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:339361/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:348067/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:406583/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:49449/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:576890/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:155788/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:689772/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:756468/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:764917/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:790533/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:792973/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:843681/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:877178/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:932470/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:964692/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:996765/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1290261/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1048763/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1105281/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1134358/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1149430/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:116001/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1184476/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1206171/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1208756/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1210525/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1219660/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1026605/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:131653/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1333127/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1362612/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1391567/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1411557/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1425687/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1437942/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1527407/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1550420/1‑65 (MQ=255) gagCGATCTGTTGTTTACCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1363289/1‑65 (MQ=255) gagCGAACTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGc  >  1:1178/1‑65 (MQ=255) |                                                                 GAGCGATCTGTTGTTTGCCCTCTCGCAACACGCGGTTGCTTTTGCCCAATCACAGCTGCATCAGC  >  minE/2408940‑2409004

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑