Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2428044	2428534	491	181 [0]	[0] 25	[rffE]	[rffE]

GCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCAGCCCCCCGACAAT  >  minE/2428535‑2428592 |                                                          gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACCCCAGccc                     >  1:272196/1‑39 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCa                         >  1:969779/1‑35 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGcccc                    >  1:838712/1‑40 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGcccc                    >  1:1140560/1‑40 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGcccc                    >  1:337027/1‑40 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGcccc                    >  1:1472153/1‑40 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGccc                     >  1:1031393/1‑39 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCgct                 >  1:648553/1‑41 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCgc                  >  1:690978/1‑41 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGa                  >  1:108186/1‑42 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGa                  >  1:852971/1‑42 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGa                  >  1:216458/1‑42 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGCTCa               >  1:1347505/1‑45 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGCTCAGCCCCCCgg      >  1:1370886/1‑53 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGAt                 >  1:205249/1‑43 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGAt                 >  1:1421395/1‑43 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGAt                 >  1:87283/1‑43 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCa               >  1:1088548/1‑45 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCa               >  1:102784/1‑45 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCAGcccccc        >  1:371112/1‑52 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCAGCCCCCCgc      >  1:932308/1‑53 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCAGCCCCCCGa      >  1:417550/1‑54 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCAGCCCCCCGa      >  1:604100/1‑54 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCAGCCCCCCGa      >  1:1058649/1‑54 (MQ=255) gCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCAGCCCCCCGACAAt  >  1:627984/1‑58 (MQ=255) |                                                          GCTATTTCGAGCAACGGCGGGTTAATGCGACACCAGCCCCGATCAGCCCCCCGACAAT  >  minE/2428535‑2428592

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑