Missing coverage evidence...
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TCATCAAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTG  >  minE/2438564‑2438633 |                                                                      tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:277648/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:977759/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:870698/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:853349/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:851563/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:693974/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:681755/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:611332/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:606878/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:593673/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:529832/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:505588/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:500319/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:432470/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:343998/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:294117/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1049738/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:214390/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:203382/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:180983/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:167746/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1524149/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1490911/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:145779/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1441576/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1434303/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1402643/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1325992/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1303230/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1187332/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTg  >  1:1184583/1‑70 (MQ=255) tcatcaAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACAATcc                 >  1:1481824/1‑55 (MQ=255) |                                                                      TCATCAAGTCAATCAATGCCATATCGCTCATAAATTGACAATAAAATAACCATCCCCGATAATGACTTTG  >  minE/2438564‑2438633

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑