Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2542360	2542463	104	19 [0]	[0] 50	rfaK	lipopolysaccharide core biosynthesis

TTCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGA  >  minE/2542464‑2542533 |                                                                      ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGGATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1020846/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTAt               >  1:1321282/1‑57 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTa             >  1:1155612/1‑59 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGAc          >  1:881539/1‑62 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTg   >  1:763534/1‑69 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTg   >  1:167393/1‑69 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTg   >  1:695198/1‑69 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTg   >  1:1440515/1‑69 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTg   >  1:11806/1‑69 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:998070/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:429724/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:557038/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:668220/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:673264/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:681809/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:688325/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:693861/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:101669/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:694267/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:972974/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:731469/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:734945/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:999972/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:765311/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:801393/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:899893/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:857901/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:869670/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:358933/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:102790/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1071726/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1157852/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1171107/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:126629/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1301310/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1303567/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1339398/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1361755/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1405174/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1414312/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1450114/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:1504847/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:252179/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:257755/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:29692/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:319416/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:355957/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGa  >  1:416356/1‑70 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGGTCGATATTGTATTAGACCCCTTTg   >  1:137241/1‑69 (MQ=255) ttCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGAATATGCGGGAATTACAGTTCGATATTg                  >  1:813042/1‑54 (MQ=255) |                                                                      TTCTTGAAATGCTTACTCTATGTAAGCATCTGCGGGATTTACAGTTCGATATTGTATTAGACCCCTTTGA  >  minE/2542464‑2542533

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑