Missing coverage evidence...
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AAGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATAA  >  minE/2552639‑2552709 |                                                                       aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:767795/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:584589/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:633778/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:655176/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:713098/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:734533/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:748628/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:750869/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:756254/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:582572/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:844074/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:880715/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:901557/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:902087/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:915597/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:930863/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:977992/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1462632/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1147829/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1189253/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1196556/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1206280/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1361074/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1391331/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1410644/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1451941/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:1035607/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:164297/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:174933/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:205557/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:282476/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:339264/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:37337/71‑1 (MQ=255) aaGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAAGGGCTGGCGGCAGGTTATaa  <  1:399446/71‑1 (MQ=255) |                                                                       AAGTATCAACCTGCGGTTCATTCAGCAAGCTGCTGGCTTTCACCAGCGTAATGTCTGGCGGCAGGTTATAA  >  minE/2552639‑2552709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑