Missing coverage evidence...
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GCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATG  >  minE/2601037‑2601107 |                                                                       gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCAccc                                    >  1:1217534/1‑37 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGa                          >  1:1061491/1‑47 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGc                   >  1:1539198/1‑54 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAGACGCCGGTAAATg  >  1:1086764/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCgg        >  1:220578/1‑65 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:523237/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:98185/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:536166/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:54917/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:662121/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:662733/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:704156/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:732992/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:785971/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:790993/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:836070/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:860021/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:893524/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:933630/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:101553/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:457843/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:421198/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:376458/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:372155/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:357904/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:332888/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:264580/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:1419927/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:1408353/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:1344064/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:1299262/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:1296656/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:1178285/1‑71 (MQ=255) gCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATg  >  1:1127137/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GCTCTGCGTGAAGAGATGTATCGCGCTTACAGCACCCGCGCCTCCGATCAAGGCCCAAACGCCGGTAAATG  >  minE/2601037‑2601107

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑