Missing coverage evidence...
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AATAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGGTGT  >  minE/2604772‑2604842 |                                                                       aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGTTGgtgt  <  1:335534/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:247999/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:873696/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:765430/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:731342/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:719636/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:681962/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:621491/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:568308/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:566699/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:52865/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:437631/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:42955/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:401197/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:378375/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:313152/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1331136/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1077984/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1103606/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1109114/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:119495/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1213236/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1252581/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:129278/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1053178/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1415882/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1426562/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1455909/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:1525686/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:160795/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:185908/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:211491/71‑1 (MQ=255) aaTAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAACGATGGAAAATATGATGgtgt  <  1:754230/71‑1 (MQ=255) |                                                                       AATAGATTAATACACTATTACAACAGAAAATAACCAGATGATCACACTAATGATGGAAAATATGATGGTGT  >  minE/2604772‑2604842

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑