Missing coverage evidence...
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GCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGC  >  minE/201004‑201072 |                                                                     gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:647199/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:399809/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:464476/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:465667/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:496639/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:498240/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:525472/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:527854/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:577154/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:594922/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:356911/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:663129/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:71596/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:740183/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:802358/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:831247/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:841495/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:876606/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:885215/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:969192/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:285035/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1026556/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1073296/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1120236/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:125317/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1278650/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1299986/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1314170/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:136251/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1455429/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1476861/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1490935/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1491901/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1519331/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1534363/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1537254/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1016450/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTGCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:1383788/69‑1 (MQ=255) gCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTCGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGc  <  1:136656/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GCTAACGCACGGGCAATTGCCACACGTTGTTTCTGCCCACCGGAAAGATTCGACGGGTAGCTATCATGC  >  minE/201004‑201072

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑