Missing coverage evidence...
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AATGAAGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATCCCC  >  minE/2753765‑2753806 |                                          aatgaaGTCACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:287992/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:826638/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:445652/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:468122/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:497458/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:627409/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:637346/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:63835/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:667259/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:715711/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:400566/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:828710/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:855422/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:905808/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:911084/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:962124/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:975797/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:980184/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:981441/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:981966/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1541746/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1036703/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1113652/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1132007/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1207385/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1212155/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1233880/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1238412/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:139239/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1519732/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:424978/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:197532/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:266936/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:297933/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:343407/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:354060/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:372774/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:388616/42‑1 (MQ=255) aatgaaGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATcccc  <  1:1036537/42‑1 (MQ=255) |                                          AATGAAGACACCGTAATGCATCACAACAGCAGGGATATCCCC  >  minE/2753765‑2753806

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑