Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2776132	2776561	430	52 [0]	[0] 83	arpA	regulator of acetyl CoA synthetase

AACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCT  >  minE/2776562‑2776631 |                                                                      aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCGGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:133071/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:419627/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:552153/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:525483/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:503342/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:494606/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:46783/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:460462/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:44454/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:435282/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:431333/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:553779/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:386072/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:371361/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:362417/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:360584/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:333077/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:328819/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:203863/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:156067/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1560506/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:746905/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:992254/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:951446/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:932827/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:916471/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:887610/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:885121/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:859045/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:854556/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:824289/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1544641/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:737676/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:692052/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:675893/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:660835/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:637408/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:600255/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:591690/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:572298/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:572096/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1091101/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1013603/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1250589/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1249298/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1247022/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1240758/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1236622/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1218382/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1204598/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1134393/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1286140/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1089848/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1087691/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1087233/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1076647/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1074277/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1073073/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1061190/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1047043/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1020340/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1484184/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1524154/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1518122/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:151653/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1516391/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1512810/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1507935/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1507873/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1490855/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1317843/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1479471/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1474225/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1447637/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1432364/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1422759/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1409177/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1382302/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1363975/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1355469/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATCCt  <  1:315001/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGACATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:1080349/70‑1 (MQ=255) aaCATTTCTGTTCTATGTAGCTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCt  <  1:610657/70‑1 (MQ=255) |                                                                      AACATTTCTGTTCTATGTAGTTCTGGCATTTTCTGGAGTTGAATCATCAGTTGCGTAAGTTGGTGATTCT  >  minE/2776562‑2776631

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑