Missing coverage evidence...
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CTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCA  >  minE/2834513‑2834583 |                                                                       cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:4093/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:998274/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:945061/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:840911/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:796128/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:79563/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:773563/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:697203/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:678421/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:632875/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:570739/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:562214/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:548575/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:545002/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:489403/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1070109/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:393465/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:230051/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:213825/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:168904/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1559022/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1542425/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1477560/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1470081/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1445646/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1437827/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1417690/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1375543/71‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGagca  <  1:1302712/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCAGAGTGTACGCATTGTGGACGAGCA  >  minE/2834513‑2834583

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑