Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2889969	2890242	274	102 [0]	[0] 59	[msrA]	[msrA]

CATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAA  >  minE/2890243‑2890297 |                                                       cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:705300/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:189453/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:241911/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:24420/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:278463/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:283901/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:284851/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:291731/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:357929/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:380277/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:500789/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:521236/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:532068/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:561101/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:594100/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1543831/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:74388/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:754035/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:80597/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:810946/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:82816/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:829395/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:832025/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:872053/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:883205/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:884862/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:889691/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:934343/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:936304/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:942678/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1172566/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1010568/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:101169/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1017388/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1027195/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1050410/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1064225/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1080191/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1084160/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:108985/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1122675/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1122947/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1125323/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1143604/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:115062/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1006544/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1188528/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:120900/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1211127/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1282343/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:128462/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1307576/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1339421/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1453570/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1470470/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1480869/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1498329/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1502449/1‑55 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGGT‑‑TAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa  >  1:1435702/1‑53 (MQ=255) |                                                       CATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAA  >  minE/2890243‑2890297

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑