Missing coverage evidence...
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TCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTC  >  minE/2904171‑2904240 |                                                                      tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:290299/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:949517/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:878607/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:759573/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:63754/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:582657/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:557910/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:425938/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:373380/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:336982/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:1023503/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:221307/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:1556857/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:1524687/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:1450239/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:1329529/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:1266646/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:1211830/70‑1 (MQ=255) tCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTc  <  1:1113108/70‑1 (MQ=255) |                                                                      TCGTGGGGAGCTGTAGTAGCAATTATAGTCGATTAATACAACATATTGGGTTGGGACGCATTTTAAAGTC  >  minE/2904171‑2904240

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑