Missing coverage evidence...
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TTGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCACC  >  minE/2920649‑2920717 |                                                                     ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:352163/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:945073/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:925847/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:82940/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:826239/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:739337/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:65661/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:597568/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:584321/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:488168/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:482848/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:444938/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:406860/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:361663/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:1114262/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:28946/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:237694/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:208068/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:201430/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:19111/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:140122/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:138082/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:1262932/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:1201935/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:1196234/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:1165515/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:116304/69‑1 (MQ=255) ttGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGGTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCAcc  <  1:1162942/69‑1 (MQ=255) |                                                                     TTGCAGTTCGCAAATATCCGACTCACTCCCGGTTAATGGCGCTATCCCACCGCCGCCGACCACTTCACC  >  minE/2920649‑2920717

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑