Missing coverage evidence...
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TTGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTG  >  minE/2952194‑2952264 |                                                                       ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGc                                  >  1:1501929/1‑39 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACAtttt   >  1:29627/1‑70 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACAtttt   >  1:51243/1‑70 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACAtttt   >  1:720596/1‑70 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACAtttt   >  1:740516/1‑70 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACAtttt   >  1:921167/1‑70 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:845780/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:76801/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:87246/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:76719/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:511996/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:765334/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:888308/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:674460/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:627655/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:625093/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:615027/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:606848/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:97845/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:571202/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:1061713/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:499362/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:498802/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:399511/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:389099/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:377184/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:326860/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:325532/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:1520647/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:1439705/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:1434677/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:14155/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:131864/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:121934/1‑71 (MQ=255) ttGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTg  >  1:1171098/1‑71 (MQ=255) |                                                                       TTGTCATTCTGATGGGATTAGTATTGACGCCGATGATGCTGTATCACAAACAGTTGCGGCATTACATTTTG  >  minE/2952194‑2952264

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑