Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 52,517 T→C E757E (GAA→GAG)  imp ← exported protein required for envelope biosynthesis and integrity

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE52,5170TC100.0% 291.6 / NA 82E757E (GAA→GAG) impexported protein required for envelope biosynthesis and integrity
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (17/65);  total (17/65)

TGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACC  >  minE/52498‑52576
                   |                                                           
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          gCCGCGAAGCTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATccc      <  1:971660/65‑1 (MQ=255)
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          gCCGCGAAGCTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATccc      <  1:1557096/65‑1 (MQ=255)
          gCCGCGAAGCTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATccc      <  1:159054/65‑1 (MQ=255)
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                   |                                                           
TGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACC  >  minE/52498‑52576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑