BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,252,050	T→C	K6K (AAA→AAG)	yebC ←	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,252,050	0	T	C	100.0%	647.2 / NA	178	K6K (AAA→AAG)	yebC	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (110/68); total (110/68)

Only 100 of 178 total aligned reads displayed.

CAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAATT  >  minE/1252022‑1252111

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATg                                                       >  1:365908/1‑37 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATa                                             >  1:516814/1‑47 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:409989/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:599439/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:558989/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:485823/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:481136/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:465363/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:444006/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:432886/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:609704/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:394804/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:372166/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:355034/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:343160/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:336536/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:296674/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:269824/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:775572/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:959160/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:932988/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:896624/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:884459/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:845471/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:794538/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:786694/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:78409/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:100194/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:745182/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:72366/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:699610/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:686007/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:679538/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:671278/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:669446/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1155655/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1470949/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1478690/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:105823/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1067925/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1504011/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1079634/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1508218/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1538333/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1053419/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1162566/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1025396/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1166536/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1323594/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:131998/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:191180/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:201189/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:1310708/1‑71 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgc                      >  1:635637/1‑70 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgc                      >  1:554615/1‑70 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgc                      >  1:1079542/1‑70 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgc                      >  1:1069826/1‑70 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgc                      >  1:378778/1‑70 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctgc                      >  1:305245/1‑70 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCcctg                       >  1:236602/1‑69 (MQ=255)

cAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATACCTCCAGATAGCcctgcc                     >  1:129237/1‑71 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1193595/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:536117/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:972159/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1000467/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:100774/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1211784/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:813215/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:906673/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:690502/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:888667/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1056296/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:763270/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:838667/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:832895/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:447789/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:256167/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:298346/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:300880/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:307251/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:330614/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:175356/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:156785/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1548588/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:39879/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1485240/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:41672/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:427842/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:563729/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1460717/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:475170/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1458481/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1354274/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:489865/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:499515/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:501293/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:1337871/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:527082/70‑1 (MQ=255)

                    ttGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:545736/70‑1 (MQ=255)

                     tGGCCCACTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAAtt  <  1:742436/69‑1 (MQ=255)

CAGCTTTACGATGTCTGGTGTTGGCCCATTTACTATGACCTGCCATAAAAATATCTCCAGATAGCCCTGCCTGTTCAGGCAGCGTTAATT  >  minE/1252022‑1252111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`