Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,536,834	C→T	M1I (ATG→ATA) †	yfcR ←	predicted fimbrial‑like adhesin protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,536,834	0	C	T	100.0%	202.9 / NA	54	M1I (ATG→ATA) †	yfcR	predicted fimbrial‑like adhesin protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (30/24);  total (30/24)

CCCACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTCATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGC  >  minE/1536799‑1536879                                    |                                              cccACTTCAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:1801/1‑61 (MQ=255) cccACTTCAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGAGGCTCTGCTCTTc                      >  1:202313/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTg                                    >  1:315426/1‑47 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCtt                       >  1:541204/1‑60 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCtt                       >  1:128174/1‑60 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:565859/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:167916/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:244582/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:262749/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:380476/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:504133/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:1035594/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:572360/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:710786/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:77103/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:797728/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:801126/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:811015/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:96344/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:982034/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:988794/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:1174211/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:1283923/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:153139/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:1289227/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:1272944/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:1077161/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:1489200/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTc                      >  1:1028584/1‑61 (MQ=255) cccACTACAAACTTTTGACTCATAACACCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCtt                       >  1:852825/1‑60 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:1064271/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:1159952/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:520787/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:1188291/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:668809/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:643410/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:1271382/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:886476/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:1060600/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:469971/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:457363/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:424643/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:1308466/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:341922/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:1312183/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:27959/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:133808/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:1415149/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:21881/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:1493396/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCAACCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:379335/71‑1 (MQ=255)           aCTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCGCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:105941/71‑1 (MQ=255)                  aCTCATAACTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:635941/64‑1 (MQ=255)                          cTCCCCCCGTTATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGc  <  1:337738/56‑1 (MQ=255)                                    |                                              CCCACTACAAACTTTTGACTCATAACTCCCCCCGTCATCAGCCTTTGCGGCTCTGCTCTTCATCCACCTGGCAGCTGTTGC  >  minE/1536799‑1536879

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑