Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 2,109,996 G→T P75P (CCG→CCT)  agaC → N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIC component of PTS

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE2,109,9960GT100.0% 485.5 / NA 131P75P (CCG→CCT) agaCN‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIC component of PTS
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (131/0);  total (131/0)

Only 100 of 131 total aligned reads displayed.

GTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCG  >  minE/2109935‑2110005
                                                             |         
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                                                             |         
GTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCG  >  minE/2109935‑2110005

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑