| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2412349 | 54 (0.870) | 5 (0.090) | 4/106 | 5.0 | 10.4% | intergenic (+422/‑257) | hemY/aslA | predicted protoheme IX synthesis protein/acrylsulfatase‑like enzyme |
| ? | minE | = 2412356 | 40 (0.750) | intergenic (+429/‑250) | hemY/aslA | predicted protoheme IX synthesis protein/acrylsulfatase‑like enzyme | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/2412272‑2412349‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caattaataTATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAA < minE/2412356‑2412289 AACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTC > 1:2354098/1‑70AACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTC > 1:373864/1‑70 ACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAA > 1:1116966/1‑71 ACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAA < 1:1844112/71‑1 CTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAAT > 1:2340370/1‑71 CCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAA > 1:424976/1‑71 CCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTA < 1:1251415/70‑1 CTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAAT < 1:1796515/71‑1 TTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAAT > 1:2722878/1‑56 CTGAGATTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCA < 1:1575637/48‑1 AGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATATATGTGTTATTAATTGAAT > 1:1022470/1‑71 AGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATATATGTGTTATTAATTGAA < 1:444174/70‑1 GCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAAT < 1:503600/50‑1 ACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAAT < 1:1550979/40‑1 aaATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATATATGTGTTATTAA < 1:2614299/50‑1 ACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAAT < 1:2391889/38‑1 TGATAAAATTCATTCAATTAATATATGTGTTATTAATT < 1:2358461/38‑1 GATAAAATTCATTCAATTAATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAAT < 1:684213/60‑1 CAATTAATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCA > 1:1410447/1‑70 ttATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATA < 1:634870/39‑1 TAATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTT > 1:601033/1‑70 AATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGA < 1:1811765/56‑1 AATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAG > 1:535210/1‑54 ATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAA > 1:2854317/1‑71 ATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAA < 1:2984406/70‑1 ATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATC > 1:2838006/1‑55 ATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATC > 1:153405/1‑55 AACTTCCTGAGTGAATATTTAACCTGAGCTTGATCCTACACATACTTATTATGAATGATAAAATTCATTCAATTAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/2412272‑2412349‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caattaataTATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAA < minE/2412356‑2412289 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |