Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	249927	249939	13	21 [0]	[0] 20	proY	predicted cryptic proline transporter

CCGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCG  >  minE/249861‑249926                                                                  | ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTTAAGTCg  <  1:376977/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:1222639/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:668572/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:650893/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:604631/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:556298/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:424212/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:370772/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:2106264/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:1977815/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:1767613/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:1413730/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:1354228/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:1258634/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:124663/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGGGAGCTGGAATTCTGGCTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:1003627/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGAGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:1506363/66‑1 (MQ=255) ccGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATACGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:616270/66‑1 (MQ=255)  cGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:478994/65‑1 (MQ=255)   gTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCg  <  1:170589/64‑1 (MQ=255)         cTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTGAAGTCg  <  1:2100892/58‑1 (MQ=255)                                                                  | CCGTAAACCTGATGAGCGTGAAGGTATTCGGTGAGCTGGAATTCTGGTTCTCGTTCTTTAAAGTCG  >  minE/249861‑249926

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑