Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	308632	308654	23	28 [0]	[0] 54	hha	modulator of gene expression, with H‑NS

AATAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCGG  >  minE/308565‑308631                                                                   | aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1109857/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:908522/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:874517/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:778403/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:777727/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:694075/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:649627/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:636080/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:619483/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:395546/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:339287/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:272335/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:2147214/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:2064959/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1994263/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1895984/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1861469/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1860811/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1855785/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1830139/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:155655/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1549629/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:142196/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1059614/67‑1 (MQ=255) aaTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCCAGGCgg  <  1:2106772/67‑1 (MQ=255)  aTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1569077/66‑1 (MQ=255)  aTAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:1196923/66‑1 (MQ=255)   tAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCgg  <  1:276227/65‑1 (MQ=255)                                                                   | AATAAATTTCCATACTGAGGAAGGGATCTTGTCGTACAGTTTATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCGG  >  minE/308565‑308631

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑