Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	314227	314228	2	13 [0]	[0] 2	acrA/acrR	multidrug efflux system/DNA‑binding transcriptional regulator

TTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAA  >  minE/314161‑314226                                                                  | ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTTTAAATTCACGaa  <  1:1797534/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:1073452/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:1596350/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:1670088/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:1713307/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:1880323/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:2094975/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:24825/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:331279/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:53198/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:556080/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:642691/66‑1 (MQ=255) ttatCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGaa  <  1:884996/66‑1 (MQ=255)                                                                  | TTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAA  >  minE/314161‑314226

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑