Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	446062	446069	8	10 [0]	[0] 8	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

CCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGG  >  minE/446019‑446061                                           | ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:1527621/43‑1 (MQ=255) ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:1559299/43‑1 (MQ=255) ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:1598029/43‑1 (MQ=255) ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:1615824/43‑1 (MQ=255) ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:1783967/43‑1 (MQ=255) ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:2021507/43‑1 (MQ=255) ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:681615/43‑1 (MQ=255) ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:83621/43‑1 (MQ=255) ccTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:913677/43‑1 (MQ=255) acTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCgg  <  1:1370880/42‑1 (MQ=255)                                           | CCTTGCGGATGTGTTAACGGCTGCAATTTACCGTTGTCATCGG  >  minE/446019‑446061

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑