Missing coverage evidence...
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GGTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTC  >  minE/540797‑540863                                                                   | ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1058862/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:835998/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:812714/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:76074/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:533017/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:473818/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:45935/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:435549/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:342651/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:2311250/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:2235164/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:2199379/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:2152467/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:2020875/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1753096/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1707314/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1524933/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:119411/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1212090/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1254736/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1298339/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1385134/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1399449/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1413208/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:146597/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1154607/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:101084/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1547599/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1553734/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1601395/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1639469/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1667391/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGCCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1973131/67‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTGCGCTTTGGCAAAGCTCAGTCGCCATGGCTTAAAGACCGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:1676621/67‑1 (MQ=255)  gTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:2188707/66‑1 (MQ=255)  gTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:2176134/66‑1 (MQ=255)  gTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:921916/66‑1 (MQ=255)         ttGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:736619/59‑1 (MQ=255)           gCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTc  <  1:542832/57‑1 (MQ=255)                                                                   | GGTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTC  >  minE/540797‑540863

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑