Missing coverage evidence...
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ATGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAGGAATGACCCATTTTTCACA  >  minE/992137‑992213                                                         |                     aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1731307/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:965623/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:837174/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:723807/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:714660/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:580068/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:558936/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:2288670/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1989392/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:177694/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1684407/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1637016/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1632790/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1587460/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1483935/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1462368/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1289831/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1125945/57‑1 (MQ=255) aTGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGCATGTTa                      <  1:609103/57‑1 (MQ=255)            aGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAGGAATGACCCATTTTTcaca  >  1:1705801/1‑66 (MQ=255)                 aaCAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTa                      <  1:1059818/41‑1 (MQ=255)                                                         |                     ATGGCTATTGCAGGTTAACAAATTGGTGCGGGGCAACCCGCACATTTCAGGATGTTAGGAATGACCCATTTTTCACA  >  minE/992137‑992213

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑