Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	997828	997830	3	54 [0]	[1] 2	ynfM	predicted transporter

ACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATG  >  minE/997763‑997827                                                                 | aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:486421/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1064639/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:2026033/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:2026747/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:2035424/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:208890/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:211624/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:2170857/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:2207746/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:2303125/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:282214/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:293241/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:330138/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:458128/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:201739/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:504265/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:557072/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:601975/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:722404/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:789681/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:901090/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:906480/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:913551/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:947659/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:950802/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:96083/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:964769/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1588146/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1143139/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1241346/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1316622/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1348004/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1360989/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1374647/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1380672/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1423373/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1540758/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1548883/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1553281/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1570285/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1670375/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1775214/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:179173/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1798309/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:181879/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1823042/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1835928/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1897485/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:194500/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:197993/65‑1 (MQ=255) aCGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1984283/65‑1 (MQ=255)  cGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1985887/64‑1 (MQ=255)  cGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:1396337/64‑1 (MQ=255)       ttttGATTATGCGCGCCTTGATGGGGCTTTCGTTAACTGGCGGGGCAGCTGTTGGCATg  <  1:2133632/59‑1 (MQ=255)                                                                 | ACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCATG  >  minE/997763‑997827

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑