Missing coverage evidence...
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ACTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGC  >  minE/1044183‑1044249                                                                   | aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:345552/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:994051/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:9129/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:757666/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:753559/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:680468/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:601652/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:589353/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:523559/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:485498/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:460925/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:1176771/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:294610/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:2299227/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:2158965/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:1854592/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:1848676/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:1645241/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:1602791/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:1473548/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:1206132/67‑1 (MQ=255) aCTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:1201478/67‑1 (MQ=255)  cTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:1385689/66‑1 (MQ=255)  cTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:965048/66‑1 (MQ=255)    tcgccgcCTTCATTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTTCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGc  <  1:717614/63‑1 (MQ=255)                                                                   | ACTGCGCCGCCTTCAGTTTTACCAAATTTGGTGCCATCTGCTTTAGTGATCAGCGGAACGGTCAGGC  >  minE/1044183‑1044249

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑