Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1059413	1059478	66	21 [0]	[0] 19	lhr	predicted ATP‑dependent helicase

ATGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTA  >  minE/1059347‑1059412                                                                  | aTGTAACGACCACTACGCCGTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1872567/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1237163/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1027419/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1519090/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1678248/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:655301/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:584809/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:185233/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1886323/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:2026557/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:2073684/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:252301/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATATCGCGGAATTTa  <  1:531921/66‑1 (MQ=255) aTGTAACGACCACTAAGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1982189/66‑1 (MQ=255)      aCGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGTAATTTa  <  1:806203/61‑1 (MQ=255)      aCGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:2245731/61‑1 (MQ=255)      aCGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:527972/61‑1 (MQ=255)      aCGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1966474/61‑1 (MQ=255)      aCGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1837983/61‑1 (MQ=255)      aCGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1829014/61‑1 (MQ=255)      aCGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTa  <  1:1312484/61‑1 (MQ=255)                                                                  | ATGTAACGACCACTACGCCCTCGCCTTTCGCCACAAGTTTATTGTTCGGCTATGTCGCGGAATTTA  >  minE/1059347‑1059412

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑