Missing coverage evidence...
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CTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCTTCCAATGTCG  >  minE/1071943‑1072017                                                                  |          cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:1111921/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:944513/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:791572/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:693918/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:641320/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:455775/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:428138/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:418996/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:359788/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:241982/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:2252724/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:2188276/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:162763/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:1591331/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:1565097/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:1484681/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:1414795/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:1407125/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:128923/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:1288758/66‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGACCTGAACTTTAGTACACTAATGTTCGTGCtt           <  1:1394606/66‑1 (MQ=255) cTCGCTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:1016003/66‑1 (MQ=255)          gttgATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCTTCCAATGTCg  <  1:991515/66‑1 (MQ=255)                              gATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCtt           <  1:204722/37‑1 (MQ=255)                                                                  |          CTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCTTCCAATGTCG  >  minE/1071943‑1072017

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑