Missing coverage evidence...
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TTACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAA  >  minE/1145792‑1145837                                              | ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:1236395/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:851616/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:823527/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:733576/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:683993/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:61427/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:567419/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:396748/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:317633/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:2254666/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:2227599/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:2161024/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:1829383/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:1819241/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:1645479/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:1608046/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:1532807/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:1346077/1‑46 (MQ=255) ttACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:1006191/1‑46 (MQ=255) gtACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTaaacaa  >  1:989482/2‑46 (MQ=255)                                              | TTACGATGTCAAAAATCACCGGAATGGTACGCAGACCTTTAAACAA  >  minE/1145792‑1145837

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑