Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1146594	1146626	33	16 [0]	[0] 19	chbR	DNA‑binding transcriptional dual regulator

TTCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCA  >  minE/1146558‑1146593                                    | ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1118941/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1135976/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1302118/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1307126/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1351409/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1650715/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1692908/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1695389/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1765031/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1767259/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:217875/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:2291423/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:656565/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:853948/36‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:867421/36‑1 (MQ=255)  tctcCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCa  <  1:1201024/35‑1 (MQ=255)                                    | TTCTCCAGCGCCGATTCACTAAACTGCTCTTTATCA  >  minE/1146558‑1146593

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑