Missing coverage evidence...
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ATTTACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGAC  >  minE/1151273‑1151340                                                                    | aTTTACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTG‑AAGTGac  <  1:2077641/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:210474/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:782142/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:768171/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:630327/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:518069/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:49866/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:419865/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:341487/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:317922/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:303036/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:249292/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:2249524/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:2144594/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:2125638/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:2117644/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1041787/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:2050887/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:2017011/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:2016414/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1714197/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1574261/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1505373/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1490821/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1469924/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1382345/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1367721/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1200908/67‑1 (MQ=255)  tttACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1135230/67‑1 (MQ=255)             tCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:1126958/56‑1 (MQ=255)                                ccGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGac  <  1:303271/37‑1 (MQ=255)                                                                    | ATTTACGTTCATTCCTTAATGACTTACCCACCCGACCAGGGGTGTATCTGTTTCATGGTGAAAGTGAC  >  minE/1151273‑1151340

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑