Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1178236	1178242	7	13 [0]	[0] 49	sppA	protease IV

ATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGG  >  minE/1178171‑1178235                                                                 | atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:1264901/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:1454103/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:1493226/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:1500442/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:2049234/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:321907/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:361857/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:494779/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:520086/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:920187/65‑1 (MQ=255) atatTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:925938/65‑1 (MQ=255)  tatTACGTTGATGAACTGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:694701/64‑1 (MQ=255)          tgatgaACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCggg  <  1:176739/56‑1 (MQ=255)                                                                 | ATATTACGTTGATGAACCGACCTTCTTCGACAAAGTGATGGACAACATGTCTGGTTCTGTCCGGG  >  minE/1178171‑1178235

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑