Missing coverage evidence...
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GGTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAG  >  minE/1275229‑1275294                                                                  | ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:2194571/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:962726/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:945275/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:90461/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:845993/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:786009/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:778350/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:706995/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:70097/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:677742/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:539364/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:52857/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:258643/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:2228420/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:2210910/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1014877/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:2018643/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1979066/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1928216/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1766393/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1697065/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1547439/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1518962/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1490467/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1340771/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1300675/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:128652/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:1141127/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:111747/1‑66 (MQ=255) ggTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAg  >  1:110685/1‑66 (MQ=255)                                                                  | GGTAATGATTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAG  >  minE/1275229‑1275294

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑