Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1287295 1287312 18 11 [0] [0] 19 shiA shikimate transporter

TTAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTATTCT  >  minE/1287242‑1287294
                                                    |
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:1359677/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:1588005/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:1779990/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:1998458/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:2161669/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:321581/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:420962/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:5682/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:664917/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:71538/1‑53 (MQ=255)
ttAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTAttct  >  1:7663/1‑53 (MQ=255)
                                                    |
TTAATGCTGACCGTCTGGATGATGGGCATCGCGACAGCCTTGATTGGTATTCT  >  minE/1287242‑1287294

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: