Missing coverage evidence...
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TTTCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGAA  >  minE/1299813‑1299877                                                                 | tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:606155/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:2091759/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:214168/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:2144853/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:2232109/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:2250050/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:2317336/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:279967/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:30737/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:353931/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:2079818/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:687048/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:705725/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:754073/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:770705/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:794236/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:82870/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:9340/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:955918/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:993619/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1620294/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1028766/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1067055/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1125575/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1154260/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1275382/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1350587/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1602686/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:160898/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1008825/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1621622/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1796547/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1892852/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1898411/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:2037437/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:205839/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:2063135/65‑1 (MQ=255) tttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTACAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1601392/65‑1 (MQ=255)  ttCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGaa  <  1:1666228/64‑1 (MQ=255)                                                                 | TTTCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGAA  >  minE/1299813‑1299877

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑