Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1411221	1411297	77	12 [0]	[0] 2	rsuA	16S rRNA pseudouridylate 516 synthase

AAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGT  >  minE/1411154‑1411220                                                                   | aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCTGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:17933/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:1092643/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:1259969/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:142542/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:1583731/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:2052088/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:216606/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:453170/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:632236/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:659377/67‑1 (MQ=255) aaaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:685091/67‑1 (MQ=255)  aaaaCAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGt  <  1:2084868/66‑1 (MQ=255)                                                                   | AAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTCCTGAAAGTCATTGAAAAGT  >  minE/1411154‑1411220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑