Missing coverage evidence...
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TGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGTT  >  minE/1428135‑1428201                                                                   | tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:2023620/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:914704/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:853194/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:71628/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:703511/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:455630/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:386707/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:377198/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:293310/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:241744/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:2274600/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1121925/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1988073/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1904140/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1808931/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1769776/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1759411/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1704050/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1670432/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1350260/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1283608/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1228460/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:114424/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGACACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1652503/67‑1 (MQ=255)  gCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:1878746/66‑1 (MQ=255)  gCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:2210148/66‑1 (MQ=255)                  ggTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:2177011/50‑1 (MQ=255)                    tAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:822720/48‑1 (MQ=255)                            cacaGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGtt  <  1:2185524/40‑1 (MQ=255)                                                                   | TGCTCCAGAACGCGTCCGGTAGAGAGCCACAGGTCGTACTCTTCATCCGGTGCTTCCGCCGCCGGTT  >  minE/1428135‑1428201

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑