Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1444937	1444939	3	24 [0]	[0] 2	rcsC	hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

GGTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGATCA  >  minE/1444870‑1444936                                                                   | ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1913367/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:974860/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:922744/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:894129/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:840579/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:38712/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:2304063/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:2275558/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:2225373/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:2203683/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1017630/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1910768/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1842388/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1786474/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1602949/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1407103/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1388734/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:138091/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1319092/67‑1 (MQ=255) ggTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1078210/67‑1 (MQ=255)  gTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:361738/66‑1 (MQ=255)  gTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1048778/66‑1 (MQ=255)     ttACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:1656098/63‑1 (MQ=255)                    aaCGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGatca  <  1:794819/48‑1 (MQ=255)                                                                   | GGTTTTACATTGATAGCCCAACGATCCCAACTGATCTGCCAGCAAACGCCGGTTAATCGGATGATCA  >  minE/1444870‑1444936

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑