Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1449679	1449683	5	34 [0]	[0] 40	atoC	fused response regulator of ato opeon, in two‑component system with AtoS

GGCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGAA  >  minE/1449612‑1449678                                                                   | ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACGCCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:47976/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1872912/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1860871/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1905226/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1907217/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1925158/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:2034164/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:2186705/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:290100/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:470596/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:528270/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:589636/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:627997/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:647506/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:699209/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:758149/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:995819/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1498708/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1089706/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1115863/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1120764/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1179904/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:120523/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1212860/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1451926/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1042119/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1560844/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1563434/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1575418/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1646765/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1734354/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1750843/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1773037/1‑67 (MQ=255) ggCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCAGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGaa  >  1:1384355/1‑67 (MQ=255)                                                                   | GGCACTAAAGGAGATGCGCAGCCATGAGACCCGGACACCCGTTATTCTGATGACGGCCTATGCGGAA  >  minE/1449612‑1449678

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑